Секвенаторы ДНК по Сэнгеру

Современный капиллярный секвенатор (капиллярный генетический анализатор, секвенатор 1 поколения, классический секвенатор) — автоматический прибор, позволяющий проводить секвенирование и фрагментный анализ нуклеиновых кислот по методу Сэнгера (см. ниже). Разделение фрагментов ДНК сейчас в автоматических капиллярных секвенаторах проводится путем капиллярного электрофореза, ранее это делалось в ручную в плоских гелях с использованием радиоактивной метки.
Каталоги, статьи, видео
Каталоги
Фильтр
развернуть все
Все производители
Все категории
Пока нет данных. Перейти в каталог
Фильтр
Доступность
  • На складе
  • В транзите
  • В транзите и на складе
  • Все товары
Генные технологии здоровья, Китай

Генетический анализатор 16-капиллярный A16

6-07-0135
New
По запросу

Генетический анализатор A16 — 16-капиллярный прибор китайской компании Генные технологии здоровья (аналог генетического анализатора Locus Seqtor 1616 для секвенирования и фрагментного анализа). Прибор позволяет проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК, полученных в ходе реакции циклического секвенирования по Сэнгеру либо фрагментный анализ ДНК после ПЦР, рестриктазного расщепления и других методов молекулярной генетики.

Принципиально прибор выполнен по «открытой» схеме использования расходных материалов и не предполагает RFID-идентификации расходки. Таким образом на нем можно использовать полимеры во флаконах и буфер для электрофореза различных производителей.

Cистема передачи оптического сигнала секвенатора A16 ( аналог генетического анализатора Locus Seqtor 1616 для секвенирования и фрагментного анализа) выполнена по стандартной зеркально-линзовой схеме как и у других приборов аналогичного класса, признанных мировым стандартом в этой технологии (3500 Applied Biosystems).

Характеристики генетического анализатора A16

  • Количество капилляров в блоке — 16;
  • диапазон напряжения, кВ — 0-20;
  • тип лазера — твердотельный;
  • мощность лазера, мВт — 50;
  • длина волны лазера, нм — 505;
  • диапазон флуоресцентной детекции, нм — 522-650;
  • количество одновременно детектируемых красителей — 8;
  • вместимость автосэмплера — два 96-луночных планшета;
  • используемые капилляры, см — 36 и 50;
  • формат файлов — .fsa/.abi
  • обязательное подключение к ПК;
  • габариты (Ш×Г×В), мм — 750×550×900;
  • вес — 120 кг;
  • гарантийный срок — 1 год.

Комплект поставки:

  • генетический анализатор;
  • компьютер с управляющим ПО;
  • набор принадлежностей;
  • капиллярная сборка;
  • инсталляционный набор расходных материалов (полимер, буфер, формамид).
  • Генетический анализатор 16-капиллярный A16
Генные технологии здоровья, Китай

Генетический анализатор 16-капиллярный G16

6-07-0122
New
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу

Генетический анализатор G16 — 16-капиллярный прибор из новейшей серии капиллярных генетических анализаторов китайской компании Генные технологии здоровья. Прибор позволяет проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК, полученных в ходе реакции циклического секвенирования по Сэнгеру либо фрагментный анализ ДНК после ПЦР, рестриктазного расщепления и других методов молекулярной генетики.

Принципиально прибор выполнен по «открытой» схеме использования расходных материалов и не предполагает RFID-идентификации расходки. Таким образом на нем можно использовать полимеры во флаконах и буфер для электрофореза различных производителей.

Ключевым отличием данной серии от других генетических анализаторов является двухлучевая оптоволоконная система передачи оптического сигнала, которая в отличие от стандартной (зеркально-линзовой) схемы требует меньших усилий по сервисному обслуживанию, настройке и юстировке приборов, а также способствует повышению однородности сигнала.

Характеристики генетического анализатора G16

  • Количество капилляров в блоке — 16;
  • диапазон напряжения, кВ — 0-20;
  • тип лазера — твердотельный;
  • мощность лазера, мВт — 50;
  • длина волны лазера, нм — 505;
  • диапазон флуоресцентной детекции, нм — 522-650;
  • количество одновременно детектируемых красителей — 8;
  • вместимость автосэмплера — два 96-луночных планшета;
  • используемые капилляры, см — 36 и 50;
  • формат файлов — .fsa/.abi
  • обязательное подключение к ПК;
  • габариты (Ш×Г×В), мм — 710×610×820;
  • вес — 105 кг;
  • гарантийный срок — 1 год.

Комплект поставки:

  • генетический анализатор;
  • компьютер с управляющим ПО;
  • набор принадлежностей;
  • капиллярная сборка;
  • инсталляционный набор расходных материалов (полимер, буфер, формамид).
  • Генетический анализатор 16-капиллярный G16
Генные технологии здоровья, Китай

Генетический анализатор 24-капиллярный G24

6-07-0123
New
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу
Подобрать аналог

Генетический анализатор G24 — 24-капиллярный прибор из новейшей серии капиллярных генетических анализаторов китайской компании Генные технологии здоровья. Прибор позволяет проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК, полученных в ходе реакции циклического секвенирования по Сэнгеру либо фрагментный анализ ДНК после ПЦР, рестриктазного расщепления и других методов молекулярной генетики.

Принципиально прибор выполнен по «открытой» схеме использования расходных материалов и не предполагает RFID-идентификации расходки. Таким образом на нем можно использовать полимеры во флаконах и буфер для электрофореза различных производителей.

Ключевым отличием данной серии от других генетических анализаторов является двухлучевая оптоволоконная система передачи оптического сигнала, которая в отличие от стандартной (зеркально-линзовой) схемы требует меньших усилий по сервисному обслуживанию, настройке и юстировке приборов, а также способствует повышению однородности сигнала.

Характеристики генетического анализатора G24

  • Количество капилляров в блоке — 24;
  • диапазон напряжения, кВ — 0-20;
  • тип лазера — твердотельный;
  • мощность лазера, мВт — 50;
  • длина волны лазера, нм — 505;
  • диапазон флуоресцентной детекции, нм — 522-650;
  • количество одновременно детектируемых красителей — 8;
  • вместимость автосэмплера — два 96-луночных планшета;
  • используемые капилляры, см — 36 и 50;
  • формат файлов — .fsa/.abi
  • обязательное подключение к ПК;
  • габариты (Ш×Г×В), мм — 710×610×820;
  • вес — 105 кг;
  • гарантийный срок — 1 год.

Комплект поставки:

  • генетический анализатор;
  • компьютер с управляющим ПО;
  • набор принадлежностей;
  • капиллярная сборка;
  • инсталляционный набор расходных материалов (полимер, буфер, формамид).
  • Генетический анализатор 24-капиллярный G24
Генные технологии здоровья, Китай

Генетический анализатор 8-капиллярный G08

6-07-0121
New
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу

Генетический анализатор G08 (аналог генетического анализатора 3500 Applied Biosystems) — 8-капиллярный прибор из новейшей серии капиллярных генетических анализаторов китайской компании Генные технологии здоровья. Прибор позволяет проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК, полученных в ходе реакции циклического секвенирования по Сэнгеру либо фрагментный анализ ДНК после ПЦР, рестриктазного расщепления и других методов молекулярной генетики.

Принципиально прибор выполнен по «открытой» схеме использования расходных материалов и не предполагает RFID-идентификации расходки. Таким образом на нем можно использовать полимеры во флаконах и буфер для электрофореза различных производителей.

Ключевым отличием данной серии от других генетических анализаторов является двухлучевая оптоволоконная система передачи оптического сигнала, которая в отличие от стандартной (зеркально-линзовой) схемы требует меньших усилий по сервисному обслуживанию, настройке и юстировке приборов, а также способствует повышению однородности сигнала.

Характеристики генетического анализатора G08 (аналог генетического анализатора 3500 Applied Biosystems)

  • Количество капилляров в блоке — 8;
  • диапазон напряжения, кВ — 0-20;
  • тип лазера — твердотельный;
  • мощность лазера, мВт — 50;
  • длина волны лазера, нм — 505;
  • диапазон флуоресцентной детекции, нм — 522-650;
  • количество одновременно детектируемых красителей — 8;
  • вместимость автосэмплера — два 96-луночных планшета;
  • используемые капилляры, см — 36 и 50;
  • формат файлов — .fsa/.abi
  • обязательное подключение к ПК;
  • габариты (Ш×Г×В), мм — 710×610×820;
  • вес — 105 кг;
  • гарантийный срок — 1 год.

Комплект поставки:

  • генетический анализатор;
  • компьютер с управляющим ПО;
  • набор принадлежностей;
  • капиллярная сборка;
  • инсталляционный набор расходных материалов (полимер, буфер, формамид).
  • Генетический анализатор 8-капиллярный G08, ГТЗ

Современный капиллярный секвенатор (капиллярный генетический анализатор, секвенатор 1 поколения, классический секвенатор) — автоматический прибор, позволяющий проводить секвенирование и фрагментный анализ нуклеиновых кислот по методу Сэнгера (см. ниже). Разделение фрагментов ДНК сейчас в автоматических капиллярных секвенаторах проводится путем капиллярного электрофореза, ранее это делалось в ручную в плоских гелях с использованием радиоактивной метки.

В капиллярном секвенаторе для анализа используется гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины). Обычно до начала секвенирования производят амплификацию участков ДНК, последовательность которых требуется определить. В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.

В отличие от капиллярных секвенаторов в NGS–секвенаторах возможно секвенирование негомогенных проб ("библиотека" молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников).

3500-tech.jpg

Устройство капиллярного секвенатора

Секвенирование ДНК по Сэнгеру — «золотой стандарт» секвенирования, это самый точный метод определения последовательности ДНК на сегодняшний день, который использует относительно дешевые расходные материалы при небольшом потоке образцов. Принцип метода — встраивание терминирующих нуклеотидов (модифицированные трифосфаты, обладающие в 3'-положении водородом вместо гидроксильной группы, поэтому при их включении в ДНК происходит прекращение синтеза цепи) в синтезируемую цепь ДНК. В реакционной смеси находятся ДНК-матрица, праймер, ДНК-полимераза и смесь дезоксинуклеотидтрифосфатов и их модифицированных аналогов — дидезоксинуклеотидтрифосфатов. В современной версии секвенирования ДНК по Сэнгеру каждый терминирующий трифосфат (ddATP, ddGTP, ddTTP и ddCTP) помечен соответствующим флуоресцентным красителем. Поэтому фрагменты ДНК светятся разным цветом — в зависимости от того, какой терминирующий трифосфат встроился в цепь.

Реакцию проводят циклически (аналогично ПЦР), многократно повторяя синтез новых одноцепочечных фрагментов. Так как ddNTP составляют около 5% от dNTP, в конце такой (линейной) амплификации после 40-50 циклов получается набор одиночных цепей ДНК, отличающихся по длине на 1 нуклеотид и всегда заканчивающихся меченым нуклеотидом.

Разделение фрагментов по длине происходит с помощью капиллярного электрофореза, визуализация результата представляет собой электрофореграмму с цветными пиками. В настоящее время длина секвенируемых таким способом фрагментов достигает 1000 пар нуклеотидов.

Области применения капиллярных секвенаторов: секвенирование геномов de novo, SNP-типирование (онкология, сельскохозяйственная геномика) подтверждение данных NGS-секвенирования, секвенирование микроорганизмов, секвенирование митохондриальной ДНК (анализ родства).

Фрагментный анализ ДНК — разделение флуоресцентно меченых фрагментов ДНК с целью определения их «относительного» размера — широко применяемый метод исследования ДНК. Метод основан на электрофоретическом разделении фрагментов ДНК, но при этом определяется «относительная» длина каждого фрагмента в парах нуклеотидов. Это достигается тем, что один из праймеров, участвующих в ПЦР перед стадией электрофореза несет на себе флуоресцентную метку, которой метятся фрагменты определенной длины. Затем проводят электрофорез в присутствии фрагментов ДНК известной длины (размерный стандарт) и устанавливают длины исследуемых фрагментов ДНК. Фрагментный анализ возможно проводить и с помощью других методов электрофореза (горизонтальный электрофорез с последующей трансиллюминацией, электрофорез капиллярный на чипе), однако использование для фрагментного анализа капиллярных секвенаторов позволяет определять длины фрагментов с точностью до 0,5 нуклеотида*, что весьма важно для STR- и SNP-генотипирования.

*Измерение длины фрагментов, разгоняемых по полимеру, относительное, производится на основании калибровочной прямой в ходе разгона размерного стандарта и, соответственно, относительные длины вычисляются вплоть до сотых долей нуклеотида Чем выше разрешающая способность, тем легче и точнее различаются между собой фрагменты с разницей в 1 нуклеотид. Кроме того, при амплификации (например, в результате неполного аденилирования) возникает множество артефактов с длиной как раз отличающейся на 1 нуклеотид от истинного аллеля, но с низкой RFU, и повышение разрешающей способности становится важным. На горизонтальном электрофорезе такие фрагменты различить сложно и это часто приводило к ошибкам раньше.

Области применения фрагментного анализа: анализ STR маркеров человека (идентификация личности, анализ родства, наследственные заболевания, идентификация клеточных линий и многое другое), генотипирование животных (паспортизация и идентификация), генотипирование растений (виноград, картофель, свекла и другие культуры), SNP генотипирование.
DNA-Sequencing-Seng.jpeg

Принцип секвенирования по Сэнгеру


Главный критерий выбора капиллярного секвенатораколичество капилляров (от 4 до 96) и в зависимости от этого производительность по количеству исследованных образцов в день.

Для лаборатории с невысокой производительностью оптимально подойдет секвенатор с 4 капиллярами (до 128 образцов в день) SeqStudio, который к тому же имеет картридж со встроенной помпой и реагентами, что позволяет свести обслуживание прибора к минимуму.

Для большинства лабораторий стандартной производительности оптимальным решением будет 8-капиллярный (до 256 образцов в день) секвенатор. В случае высокой производительности лаборатории необходим в секвенатор с 24, 48 или даже 96 капиллярами.

Наличие Регистрационного удостоверения РосЗдравНадзора уточняйте у специалистов Диаэм.
DNA-Sequencing_2.jpg
Типичная электрофореграмма фрагментного анализа


Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!